PARAT Fabrice

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Team

Cytoskeleton and Neurophysiopathology

Localisation

Faculté de médecine, 3ème étage, Aile Rouge

Fonctions

Activités principales :

  • Mise en œuvre de techniques de biochimie, biologie cellulaire et moléculaire dans le but d’obtenir et d’analyser des échantillons d’origine cellulaire pour étudier les propriétés d’adhérence et de migration des cellules eucaryotes.
  • Gestion de l’expérimentation animale de l’équipe et des stocks de plasmides et réactifs de biologie moléculaire.
  • Développer des nouveaux modèles cellulaires d’étude pour l’équipe (Transgénèse, CrispR, OGM).
  • Assurer la mise en place et le suivi des TP en participant aux activités d’enseignement.

- Suit les évolutions techniques du domaine par la bibliographie et développe de nouveaux protocoles.
- Forme les stagiaires et les étudiants de Licence jusqu’à la 2ème année de Thèse aux techniques de recherche liées aux activités expérimentales
- Gère des banques d’échantillons (cellules eucaryotes et procaryotes, plasmides…)
- Conduit des expériences courantes de biochimie, biologie cellulaire, moléculaire et d’expérimentation animale
- Analyse et présente les données expérimentales, consigne et met en forme les résultats
- Applique et fait appliquer les règles de sécurité (élimination des déchets, autoclavage)

Domaines de recherche

Techniques maîtrisées
- Culture cellules souche (glioblastomes/U87): inclusion des sphéroïdes en OCT + coupe au cryostat
- Culture cellules d'adénocarcinomes colique (HT29, Caco2…) et autres (HaCaT, HEK, PC12, U87...)
- Préparation et obtention de lignées stables -> invalidation de gènes par technique ShRNA ou CRISPR/Cas9
- Expertise in vivo (niveau A et B + chirurgie expérimentale) -> xénogreffe orthotopique chez la souris
- Coupes des cerveaux en paraffine au microtome et coloration hématoxyline/éosine
- Microscopie Confocale -> Prise de clichés de différents types cellulaires de glioblastomes U138, U87, U118…
- Etude des voies de signalisation AKT/PI3K et ERK1,2 à l’aide de techniques de biologie cellulaire et immunologique
- Production de protéines recombinantes dans différents systèmes d’expression
- Purification de protéines : échange d’ions, affinité
- Test adhérence cellulaire sur protéines purifiées
- Immunoprécipition - PAGE/SDS - immunotransfert – Immunofluorescence - Cytométrie en flux - tri cellulaire
- Construction d’ADN recombinants (clônage, purification et analyses, culture et transformation bactérienne…)
- Optimisation des techniques de transfection (CaCl2, lipofectamine, nucléofection)
- Migration en WH sur différentes MEC et vidéomicroscopie
 

Enseignements

ACTIVITES PEDAGOGIQUES
(Collaboration avec les maîtres de conférences depuis 1995)

- Master de Biologie Cellulaire et Physiologie mention biologie générale
Travaux pratiques de Biologie Moléculaire

- L3 de Sciences Naturelles
Travaux pratiques de Biologie Moléculaire
’’Connaissances et Techniques du Gène’’ (CTG1 et CTG2)

Publications

Aix-Marseille Université      

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